Program Studi Sanitasi Kampus Magetan yang sebelumnya bernama program Studi Ksehatan Lingkungan Kampus Magetan ini didirikan pada tahun 2001 dan berada dibawah naungan Kementerian Kesehatan RI..

Tanggal 13 – 15 November 2020, program studi D3 sanitasi melakukan akreditasi melalui daring menggunakan aplikasi zoom meeting karena kondisi lapangan belum memungkinkan untuk melakukan asesmen lapangan secara langsung karena pandemic Covid 19. Tim asesor LAM-PTKes terdiri dari 2 orang, yaitu Dr. Mohammad Zen Rahfiludin, SKM., M.Kes dan Kusrini Wulandari, SKM., M.Kes.

Kegiatan akreditasi ini diharapkan mampu mendorong Poltekkes Kemenkes Surabaya untuk terus menjaga mutu khususnya pada Program Studi Sanitasi serta mampu mengahasilkan sumber daya manusia yang berkualitas dan dapat memberikan kontribusi terhadap masalah yang ada di masyarakat.